《國家機密2》是一部扣人心弦的現代諜戰(zhàn)劇。故事始于一陣深夜的緊急電話：八所工程師在火車站丟失了裝有重要科研項目的機密文件包。偵察員林云飛奉命介入，卻在看似已破的普通盜竊案中發(fā)現了蹊蹺。經驗豐富的洪處長敏銳判斷此為間諜案，并迅速接手。調查指向嫌疑人張銓，然而張銓卻在詢問前離奇被殺，線索中斷。上級緊急通報，失竊情報可能在48小時內通過衛(wèi)星自動發(fā)射，時間緊迫。 關鍵時刻，林云飛運用特殊偵察手段，成功迫使代號“無面人”的境外間諜認罪，截獲了情報。然而勝利的喜悅還未散去，新的危機接踵而至——本市另一重點科研機構“動力所”的重要科研計劃遭泄露。年輕的女偵察員石慧空降成為專案組新負責人。為深入調查，林云飛化身動力所辦公室副主任潛入內部，竟發(fā)現火箭燃料K1樣品不翼而飛。經過縝密推理，他大膽懷疑工程師袁知方監(jiān)守自盜，由此牽引出背后代號“戴安娜”的境外間諜小組。行動雖截獲部分樣品，卻發(fā)現K1已少了一半，暗示背后黑手仍未現身。 隨著偵查深入，一個神秘女人——TTC公司董事長金夢浮出水面。她實為境外間諜組織成員，利用公司為掩護竊取情報，并對背景特殊的林云飛產生濃厚興趣。為此，石慧制定險棋：派林云飛打入TTC公司近敵偵察。在間諜組織嚴酷的信任考驗中，林云飛與戰(zhàn)友緊密配合，化解一次次危機，逐步取得金夢信任。然而，負責組織安全的王躍龍始終對他心存戒備。就在林云飛工作漸入佳境之時，動力所火箭燃料K2配方再度失竊，一場更加復雜兇險的暗戰(zhàn)就此拉開序幕。劇情環(huán)環(huán)相扣，生動刻畫了國安戰(zhàn)士在無形戰(zhàn)線上與敵人斗智斗勇、捍衛(wèi)國家安全的英勇故事。